녹조가 발생하면 초기에 청주식초를 투여하여 확산을 방지할 수 있다. 비용이 가장 적게 드는 효율적인 방법이다. 방치하여 강 전체로 녹조가 확산된 이후에는 빙초산을 투여하여 녹조를 제거하는 방식이 경제적이다. 약 500:1 정도로 희석이 되어도 녹조의 증식환경이 무너지기 때문이다. 빙초산을 투여한 후, 24시간이 지난 후에는 반드시 청주식초를 투여하여야 하며 생식초를 투여해야 한다. 생식초의 아세토박터균은 녹조의 원인균을 살균하며 녹조의 원인이 되는 인과 칼슘 등의 무기질과 중금속을 분해하여 강물 혹은 하천의 생태계를 건강한 하천으로 복원해 주기 때문이다. 희석율은 50:1 정도의 비율이 추천된다. 

천연식초를 적용하면 적, 녹조현상의 원인을 유발하는 인, 칼슘, 질소에 대해 대단한 효력을 발휘한다. 천연식초의 두 가지 특질인 살균력과 산화력이 동시에 작동하기 때문이다. 천연식초는 부패과정에서 분해된 인을 재분해하고 결합하여 아데노신삼인산(ATP) 분자 형태로 합성하여 물고기의 영양소로 재탄생시킨다. 이 과정에서 인을 빼앗긴 적조는 결집력과 생장력을 잃고 소멸된다. 녹조 역시 마찬가지의 과정을 거쳐 소멸된다. 따라서 천연식초를 활용한 적조 및 녹조 제거 효과는 가장 확실한 처방이다. 지구상에서 가장 강력한 미생물인 아세토박터균을 활용하여 먹이사슬의 하위인 녹조균이나 적조균을 멸균시키는 일은 가장 과학적인 방법이다. 

청주식초는, 가장 싼 가격으로 대량생산할 수 있는 천연식초이다. 따라서 경제면에서나 산업 경쟁 면에서도 청주식초를 능가할 천연식초는 없다. 그러므로 청주식초를 산업용으로 개발하여야할 당위성이 있다.