혁신도시 사업지구가 진천 음성 2개 군에 걸쳐 있음으로 인해 혁신도시 조기활성화를 위한 주요시설 배치 등 향후 두 지역간에 발생 가능한 갈등 및 민원 등에 대해 공동대처 하기 위함이다.

주요협약 내용은 ‘공공기관 이전과 성공적인 혁신도시 건설에 따른 민원발생 등에 대해 공동대처 하고, 혁신도시내로 이전하는 공공기관과 주요시설 배치 및 토지이용계획은 효율성에 우선하며, 사업시행자의 계획에 의한 충청북도의 결정에 따른다.’ 등 이다.

앞으로 혁신도시 건설은 기본구상 및 지구지정(2006년 9월), 개발 및 실시계획(2007년 11월)을 거쳐 2007년 12월 착공하여 2012년 12월 조성 및 공공기관 이전을 완료할 계획이다.