운영시간은 오전 7시 30분부터 오후 9시까지이며 자녀와 함께 출근하고 퇴근하는 형태로 운영하고 있다.

아동 반편성은 영아반 4개, 유아반 1개반으로 운영하고 있으며 맞벌이 직원들을 위해 타 보육시설을 이용하다가 야근으로 인해 저녁에 보호자가 없는 직원을 위한 시간연장 보육도 실시하고 있다.

늦게 퇴근하는 직원들의 육아부담을 덜어주기 위해 저녁 급식까지 제공하고 있으며 몰펀, 사물놀이, 체육활동 등 다양한 보육프로그램을 운영하고 있다.

한편, 제주특별자치도청은 도내 5개군데 직장보육시설 중 의무사업장 중 한 곳으로 장소와 예산 문제로 어려움을 겪다가 이번에 직장보육시설이 설치됨으로써 출산장려 인프라 구축 및 일 가정 양립을 위한 직장문화 조성에도 크게 기여할 것으로 기대하고 있으며 보육교사 채용으로 인한 일자리 창출에도 기여하고 있다.

이에 제주도청 여직원들은"여러가지 사항으로 인하여 야근이 필요시에 아이들 걱정으로 일을 추진하는데 신경이 분산되는 경향이 있었다"며"이제 직장어린이집이 생겨 일하는데도 힘이난다.그리고 출근과 퇴근길을 아이들과 함께라서 하루하루가 너무 즐겁다"라며 반겼다.